Для проведения анализа, необходимо настроить микроскоп для получения контрастного изображения сперматозоидов, затем немного расфокусировать изображение, немного опустив стол для устранения бликования головок сперматозоидов.

Для старта анализа необходимо нажать кнопку "Захват".После захвата видео ролика программа переходит к его обработке. При этом идет построение траекторий движения сперматозоидов. После окончания обработки, траектории меняют свои цвета в соответствии с классификацией сперматозоидов по классам подвижности согласно критериям ВОЗ.

При необходимости учета концентрации Лейкоцитов, Круглых клеток и Клеток сперматогенеза, программа позволяет вручную отмечать соответствующие клетки, а затем рассчитывает их концентрацию и заносит результаты в базу данных. Для этого надо поставить курсор на клетку, нажать правую кнопку мыши и выбрать в меню нужный тип клетки. На клетке ставится цветная метка.